Cell Rep. Methods | 深度学习驱动代谢相关寡肽候选物发现
要点:DRUGONE 人工智能正在加速治疗性肽的发现,但现有方法主要集中于抗菌肽、抗癌肽和细胞穿透肽等拥有大量训练数据的领域。对于代谢、内分泌和组织再生等疾病场景,可用于训练的已验证活性肽数量有限,导致传统依赖“活性肽—非活性肽”监督数据的AI模型难以推广。针对这一问题,研究人员开发了 Deepeptide,一种无需针对每种适应证重新收集大量阳性肽数据的通用深度学习寡肽发现框架。 Deepeptide的核心思想是利用“疾病适应证—生物过程—分子功能”之间的内在联系。研究人员首先确定能够改善目标疾病的生物过程及相关分子功能,再从蛋白质组中寻找具有这些功能的内在无序区(IDR),构建大型功能性“原肽”库。随后,通过由蛋白质语言模型ESM-2、